Oct 25, 2023
Suscettibilità comparativa della SARS
The ISME Journal volume 17,
The ISME Journal volume 17, pagine 549–560 (2023)Citare questo articolo
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Esplorare i serbatoi naturali di virus patogeni è fondamentale per il loro controllo a lungo termine e per prevedere futuri scenari pandemici. Qui, un’analisi comparativa delle infezioni in vitro è stata eseguita per la prima volta su 83 colture cellulari derivate da 55 specie di mammiferi utilizzando virus pseudotipati contenenti proteine S di SARS-CoV-2, SARS-CoV e MERS-CoV. Le colture cellulari di pipistrelli ferro di cavallo di Thomas, pipistrelli ferro di cavallo reali, scimmie verdi e furetti sono risultate altamente sensibili ai virus pseudotipati SARS-CoV-2, SARS-CoV e MERS-CoV. Inoltre, cinque varianti (del69-70, D80Y, S98F, T572I e Q675H), che oltre al dominio di legame del recettore del picco, possono alterare significativamente il tropismo dell’ospite di SARS-CoV-2. Un esame dei segnali filogenetici dei tassi di trasduzione ha rivelato che i taxa strettamente correlati hanno generalmente una suscettibilità simile al MERS-CoV ma non ai virus pseudotipizzati SARS-CoV e SARS-CoV-2. Inoltre, abbiamo scoperto che l’espressione di 95 geni, ad esempio PZDK1 e APOBEC3, era comunemente associata ai tassi di trasduzione dei virus pseudotipati SARS-CoV, MERS-CoV e SARS-CoV-2. Questo studio fornisce la documentazione di base della suscettibilità, delle varianti e delle molecole che sono alla base della trasmissione tra specie di questi coronavirus.
La sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ha rappresentato una minaccia considerevole per la salute pubblica e l’economia globale, con oltre 500 milioni di casi di infezione umana e oltre 6,6 milioni di decessi in tutto il mondo a gennaio 2023. SARS-CoV- Si ipotizzava che 2 avesse avuto origine nei pipistrelli e poi fosse passato alla popolazione umana tramite un ospite animale intermedio [1,2,3]. Sebbene virus simili a SARS-CoV-2, come BANAL-20-52 derivato dal pipistrello ferro di cavallo malese (Rhinolophus malayanus), RaTG13 derivato dal pipistrello ferro di cavallo intermedio (Rhinolophus affinis) e Pangolin-CoV presente nei pangolini malesi (Manis avania) [4,5,6], attualmente l’esatta origine animale di SARS-CoV-2 rimane poco chiara. Altri due coronavirus che hanno causato epidemie prima del COVID-19 sono il coronavirus della sindrome respiratoria acuta grave (SARS-CoV), che probabilmente si è diffuso dai pipistrelli ferro di cavallo all’uomo attraverso gli zibetti delle palme infetti, e il coronavirus della sindrome respiratoria del Medio Oriente (MERS-CoV), che è stato forse una diffusione dai pipistrelli agli esseri umani attraverso i dromedari infetti [7,8,9]. Sebbene l’attuale minaccia sia della SARS-CoV che della MERS-CoV sia minima, dobbiamo essere vigili sui potenziali rischi di ricadute sugli esseri umani dai loro serbatoi naturali [10, 11].
SARS-CoV-2 è in grado di infettare un ampio spettro di ospiti tra cui cani, visoni, furetti, lontre, criceti, arvicole, cervi, topi, pipistrelli, felini piccoli e grandi e diversi primati non umani [12,13,–14 ]. Tuttavia, rimane una sfida confrontare la suscettibilità di queste specie perché non sono state utilizzate misurazioni standardizzate tra le specie. A questo proposito, diversi studi hanno previsto la probabilità di infezione da SARS-CoV-2 analizzando gli ortologhi dell’enzima 2 di conversione dell’angiotensina (ACE2). Ad esempio, Damas et al. hanno utilizzato le sequenze ACE2 di 410 specie di vertebrati e hanno scoperto che alcuni taxa in via di estinzione (ad esempio, douc dalla canna rossa, scimmie proboscide, macachi rhesus e balenottere minori antartiche) erano a più alto rischio di infezione da SARS-CoV-2 [15]. Allo stesso tempo, la risoluzione della struttura cristallina, le analisi di risonanza plasmonica superficiale e le simulazioni dinamiche molecolari sono state utilizzate per valutare l’affinità di legame di diversi ortologi ACE2 con le proteine spike [15,16,–17]. Sebbene questi studi forniscano informazioni preziose sulla probabile gamma di ospiti della SARS-CoV-2, le loro previsioni richiedono una convalida sperimentale. Inoltre, in queste previsioni gli effetti di fattori dell’ospite diversi dall’ACE2 associati all’invasione virale sono stati sottovalutati [15, 18, 19].